Suite à l’immigration irlandaise, le quartier se peuple de plus en plus et les autorités civiles songent à l’organisation de la vie urbaine, ce qui se traduit notamment par la construction de l’aqueduc en 1861. Entre 1886 et 1891, les religieuses de la Congrégation de Notre-Dame ouvrent l’école Sainte-Marguerite, dans les salles actuelles de la chapelle et du dortoir du musée. Les religieuses enseignent à la fois aux francophones et aux anglophones, jusqu’à ce que l’école Saint-Charles – aujourd’hui l’école St. Gabriel – puisse les accueillir dans un nouvel édifice construit sur la rue Wellington, près du parc Marguerite-Bourgeoys.