Plusieurs fouilles archéologiques ont été entreprises, à l'intérieur de la Maison Le Ber-Le Moyne, comme à l'extérieur sur le site.
Les premières fouilles datent de 1998 et ont mené à des découvertes majeures. Une nouvelle phase de recherches a été entreprise entre 2009 et 2014.
Journal de bord des archéologues : www.ville.montreal.qc.ca/lachine/archeologie
À partir des découvertes effectuées lors des fouilles archéologiques de 1998, on estime que les Amérindiens ont fréquenté ce site sur une période pouvant aller jusqu’à 2 500 ans avant aujourd’hui. Pourtant, en 1642, au moment de la fondation de la mission religieuse de Ville-Marie sur l’île de Montréal, il semble que les Français n’y rencontrent aucun établissement autochtone tel que décrit précédemment par Jacques Cartier.
Quelques années plus tard, en 1667, les prêtres sulpiciens qui dirigent la mission, concèdent à Cavelier de La Salle la partie sud de l’île de Montréal, alors nommée fief de la côte Saint-Sulpice.
